Ich vermute, dass es nichts mit der Monitorkalibrierung zu tun hat (die würde sich ja auch auf andere EBVs auswirken) sondern vielmehr mit den Importeinstellungen bei LR. Wenn du alle Werte auf Null stellst (es gibt da ein Preset, das in meiner englischen Version von LR "zeroed" heisst), dann werden die Bilder in der Tat u.a. dunkler, es fehlt aber auch Kontrast, Schärfe etc.
In LR 1.0 gab es noch ein Preset, das auf englisch "LR default" hiess, das konnte man eigens auswählen und bekam mittlere Helligkeit, Kontrast etc. Seit LR 1.1 gibt es die nicht mehr als eigenes Preset. Wenn du beim Import aber kein Preset wählst, macht LR genau das, was es bisher mit dem default Preset machte.
Ich vermute, dass das default herausgenommen wurde, um neue Anwender nicht zu verwirren - bei "Altanwendern" wie mir trat aber genau dewegen erst mal Verwirrung auf, bis ich's gemerkt habe. Versuch es doch mal, vielleicht liegt ja da die Lösung deines Problems.
Eines stimmt allerdings: LR ignoriert die Kamera-Einstellungen, was wohl daran liegt, dass es nicht wie etwa NX auf nur ein RAW-Format spezialisiert ist sondern RAWs von x Herstellern und Kameras lesen können soll.