Das bad-sector-remapping der modernen Festplatten und Karten funktioniert nicht so, dass es defekte Sektoren dem Filesystem "wegnimmt", sondern durch andere, funktionierende Sektoren ersetzt. Dafür wird bei der Herstellung / Grundformatierung ein Teil des Speichermediums fix reserviert. Auch wenn einzelne Sektoren defekt werden, kann sich die Speicherkapazität nicht ändern.
Wahrscheinlicher ist, dass die Karte verschieden formatiert wurde -- vielleicht einmal vorformatiert vom Hersteller, später einmal formatiert in der Kamera oder am PC, mit anderen Parametern (z.B. Größe der Zuordnungseinheiten, Anzahl der FAT-Kopien). Oder wurde vielleicht ein zweiter Ordner auf der Karte angelegt ?
LG Christoph