Die Backups von Time Machine werden auf der Backup-Platte in einem Verzeichnis "Backups.backupdb" abgespeichert, in dem für jeden einzelnen Rechner ein Unterverzeichnis angelegt wird, das den Namen des Rechners trägt (man kann also ein Festplatte auch als Time Machine Backup-Medium für mehrere Rechner benutzen).
So lange du also nichts im Verzeichnis "Backups.backupdb" ablegst, wirst du auch mit Time Machine nicht ins Gehege kommen (ausser, dass du natürlich Platz wegnimmst).
Allerdings solltest du auf einer solchen Platte nur Daten ablegen, die du nochmal woanders gespeichert hast.