Erst einmal: hoch interessante Webseite!
Zum Problem: Kann es sein, dass Du keine konstante Beleuchtung hast, sondern irgend etwas um 50Hz/100Hz schwankendes? Das würde dunkle Streifen erklären. EIn Beleuchtung mit gleichspannungsgespeister Lichtquelle wäre dann besser.
Oder: Dunkle den Raum noch weiter ab und mache dann eine Langzeitbelichtung (z.B: 10s), innerhalb derer dann das Ereignis in der Funkenkammer stattfindet. Dann muss man "nur noch" dafür sorgen, dass Raumbeleuchtung über 10s nicht so hell auf dem Bild wird, dass man das Ereignis nicht mehr sieht, weil das dann zu dunkel ist.